Celera
Celera ускорява изследванията на генетични маркери с IDBS, като помага за идентифицирането на биомаркери за коронарна болест на сърцето. Платформата за информатика за транслационни изследвания на IDBS осигурява гъвкава, управлявана от работния процес интеграция, анализ и визуализация, като ускорява научното разбиране на данните за биомаркери.
Основни точки:
- Celera имаше една цел: да може да интегрира и използва други данни от изследвания
- IDBS работи със своя екип за създаване на работни процеси за интегриране, анализ и визуализиране на вътрешни и публично достъпни данни за биомаркери.
- E-WorkBook свързва точките, рационализирайки изследванията
Предизвикателството
След като идентифицира интересни единични нуклеотидни полиморфизми (SNP) в първоначалните проучвания, Celera успешно проведе допълнителни големи проучвания за допълнително потвърждаване на асоциациите с болести и разработване на тестове за биомаркери.
Освен валидирането, учените се интересуват дали има други SNP в същия регион (или комбинации от SNP), които са по-силно свързани с индикацията за заболяване, и се интересуват от функционалното естество на генните варианти.
За да отговорят на тези въпроси, учените се нуждаят от информация от много разнообразни количествени, качествени, уеб-базирани и текстови източници на данни, което създава сложно предизвикателство за интегриране на данни.
Когато изследователите разчитат единствено на статистически анализ, могат да бъдат пропуснати критични генни варианти, което подкопава последващото проучване на литературата и биологичното анотиране и значително забавя транслационните изследвания.
Решението
IDBS и Celera са изградили работни процеси за интегриране, анализ и визуализиране на публично достъпни и вътрешни данни за биомаркери, включително филогенетични дървета, базирани на нуклеотидни и протеинови последователности, транскрипционни и протеомни профили на тъканите, общи промоторни мотиви, съвместно регулирана генна експресия, GO онтологии и мрежи за взаимодействие.
Работните процеси на IDBS автоматично анотират предполагаеми генетични маркери от публични източници на данни и продукти на трети страни.
Celera използва и адаптира няколко работни потока от IDBS CustomerHub, като по този начин се възползва от опита на общността и същевременно намалява времето за разработка.
Изследователите взаимодействат с данните с помощта на интуитивни и интерактивни инструменти за визуализация.
Резултатите
Работните потоци на IDBS осигуриха бърз и задълбочен първоначален поглед върху функционалната значимост (както молекулярната последица от варианта, така и възможните биологични процеси) за клиничния(те) фенотип(и).
IDBS улеснява критичните проучвания за проследяване на даден генен вариант, например на протеина от семейството на кинезините (KIF6), свързан с повишен риск от коронарна болест на сърцето, както и с отговора на статин.
Работните потоци на IDBS приоритизираха литературните запитвания от наличните данни и информираха за последващи проучвания, като по този начин гарантираха, че определени генни варианти са били допълнително изследвани, което има значителен принос за текущото разбиране и лечение на заболяванията.
Успех на клиента
Boehringer Ingelheim saves 6,000+ researcher hours and gets back 3 hours per experiment
Boehringer Ingelheim creates a single source of truth to turn operational inefficiencies into large gains for its global science teams
Глобална компания за биоподобни лекарства използва IDBS Polar, за да намали наполовина грешките при транскрипция на данни и да свърже >350 инструмента и системи
IDBS Polar спомогна за по-ефективно и ефикасно управление на лабораторните данни в множество развойни и аналитични функции чрез поддържане на стандартизирани, свързани работни потоци и подобрена цялост на данните.
BioIVT си сътрудничи с IDBS за внедряване на софтуерна платформа за лабораторна информатика и намаляване на времето за провеждане на изследванията с поне 30%*
Сътрудничество, което позволи на BioIVT да повиши ефективността и бързината на реакция на своите клиенти в областта на биофармацевтиката.
Пътуването на Crown Bioscience към безхартиена лаборатория с IDBS опростява и ускорява управлението на данните за целия жизнен цикъл на пробите
Внедряването на ELN на IDBS помогна на Crown Bioscience да реализира електронни експериментални записи, като оптимизира бизнес процесите ни и им помогна да бъдат по-стандартизирани.
E-WorkBook се интегрира безпроблемно с LIMS на клиента за създаване на доклади за ADA изследвания в множество серии и нива на анализ, като спестява значително време за отчитане на изследването.
Постигнато е гъвкаво решение за спестяване на време за отчитане на изследването чрез безпроблемна интеграция с E-WorkBook и LIMS на клиента.
PharmaEssentia избира IDBS Polar, за да подкрепи своята цифрова трансформация и да даде възможност за сътрудничество между екипите за научноизследователска и развойна дейност
IDBS Polar беше избран, за да помогне на екипите да събират, структурират и анализират данни от един източник на истина, което прави сътрудничеството им по-ефективно.
